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  • 基于基因組解析不同香菇菌株木質(zhì)纖維素降解酶體系的差異


    【發(fā)布日期】:2019-01-27  【來(lái)源】:食用菌學(xué)報(bào)
    【作者】楊瑞恒 李焱 吳瑩瑩 唐利華 尚俊軍 鮑大鵬
    【機(jī)構(gòu)】上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所農(nóng)業(yè)部南方食用菌資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室國(guó)家食用菌工程技術(shù)研究中心國(guó)家食用菌加工技術(shù)研發(fā)分中心 上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點(diǎn)開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室
    摘要:通過(guò)比較香菇(Lentinula edodes)野生菌株L3,NCBI已公布的菌株135A、135B、B17、NBRC 111202、W1-26,木腐菌金針菇(Flammulina velutipes)、糙皮側(cè)耳(Pleurotus ostreatus),以及草腐菌雙孢蘑菇(Agaricus bisporus)、灰蓋鬼傘(Coprinopsis cinerea)、草菇(Volvariella volvacea)的基因組。結(jié)果表明:香菇不同菌株間基因組存在較大差異,大小為36.69~46.11 Mb,基因數(shù)量為11192~14889;香菇菌株135A、135B、B17、L3、NBRC 111202和W1-26基因組注釋的碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)基因數(shù)量分別為520、520、483、475、524和537,其中L3最少,為475;纖維素酶在香菇不同菌株中基因數(shù)量為19~22,低于灰蓋鬼傘和草菇,高于雙孢蘑菇;不同香菇菌株的氧化還原酶基因數(shù)量為41~55,L3最少,為41,NBRC111202最多,為55,135A和135B最為接近。在基因水平上,木腐菌與草腐菌的木質(zhì)纖維素降解酶體系沒(méi)有完全的界限,它們之間存在一定的共性,因此木腐菌草腐化栽培存在可能性。 
    基金:上海市市級(jí)農(nóng)口系統(tǒng)青年人才成長(zhǎng)計(jì)劃[滬農(nóng)青字(2017)第1-8號(hào)]; 上海市科技興農(nóng)重點(diǎn)攻關(guān)項(xiàng)目[滬農(nóng)科攻字(2016)第6-1-3號(hào)];
    關(guān)鍵詞:碳水化合物活性酶; 纖維素酶; 木質(zhì)素酶; 氧化還原酶;
     
     
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