【作者】劉俊 馬超君 向星潔 李闖 邊銀丙 張健 肖揚(yáng)
【機(jī)構(gòu)】華中農(nóng)業(yè)大學(xué)應(yīng)用真菌研究所 湖北長(zhǎng)久菌業(yè)有限公司
摘要:以95份野生香菇(Lentinula edodes)種質(zhì)和1份栽培種質(zhì)為材料,在利用相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)標(biāo)記開(kāi)展遺傳多樣性分析的基礎(chǔ)上,采用屬性約簡(jiǎn)啟發(fā)式算法和逐步聚類位點(diǎn)優(yōu)先取樣法分別構(gòu)建核心種質(zhì)。兩種方法分別得到35份(Core 1)和29份(Core 2)種質(zhì),其核心種質(zhì)保留比分別為36.5%和30.2%,位點(diǎn)保留比分別為100%和94.7%?;谟行У任换驍?shù),Nei’s基因多樣性指數(shù),香農(nóng)信息指數(shù)等四個(gè)參數(shù)對(duì)兩組核心種質(zhì)進(jìn)行t測(cè)驗(yàn),結(jié)果顯示兩組核心樣本均能很好的代表原始種質(zhì)的遺傳多樣性,但Core1具有更高的位點(diǎn)保留比例且地理來(lái)源更加廣泛,確定為代表96個(gè)原始菌株的核心種質(zhì)庫(kù)。
基金:國(guó)家科技支撐計(jì)劃子課題(2013BAD16B02)資助;
關(guān)鍵詞:香菇; 相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性; 遺傳多樣性; 核心種質(zhì)庫(kù);