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    肺形側(cè)耳線粒體基因組多態(tài)性鑒定


    【發(fā)布日期】:2019-01-26  【來源】:菌物學(xué)報(bào)
    【作者】葉麗云 孟國良 程冰 趙麗麗 解凡 吳小平
    【機(jī)構(gòu)】福建農(nóng)林大學(xué)菌物研究中心
    摘要:線粒體是能量轉(zhuǎn)化與ATP形成的重要場所,已有多種食用真菌的線粒體基因組被相繼組裝注釋,但肺形側(cè)耳的線粒體基因組鮮有報(bào)道。本研究對(duì)野生肺形側(cè)耳X2菌株的線粒體基因組進(jìn)行組裝并注釋,由野生菌株X2與主栽菌株JX線粒體大片段差異序列,構(gòu)建分子標(biāo)記來鑒別野生和主栽肺形側(cè)耳菌株。結(jié)果顯示X2的線粒體基因組為大小75 709bp的閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu),含有r RNA的大小亞基基因,25個(gè)負(fù)責(zé)攜帶氨基酸的t RNA基因以及14個(gè)常見蛋白編碼基因,在cox1基因上含有9個(gè)內(nèi)含子。內(nèi)含子主要為IB型,包含LAGLIDADG1 superfamily、GIY-YIGCterm superfamily保守結(jié)構(gòu)域。位于菌株X2與JX內(nèi)含子和基因間區(qū)上的大片段差異序列,是造成種內(nèi)線粒體多態(tài)性的主要因素。根據(jù)兩菌株的差異片段構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹的結(jié)果顯示,內(nèi)含子、rnl-trn X、trn D-atp6序列能夠?qū)芍暌吧旰推渌髟跃陞^(qū)分開,可用于野生肺形側(cè)耳種內(nèi)鑒定,而且trn D-atp6效果最佳。 
     
    基金:秀珍菇品種選育及安全高效關(guān)鍵技術(shù)研究(KS115009A)~~;
     
    關(guān)鍵詞:野生肺形側(cè)耳; 線粒體基因組; 多態(tài)性; 種內(nèi)鑒定;
     
     
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