【作者】于慧云王嘉薈胡小平范三紅

【機構(gòu)】旱區(qū)作物逆境生物學國家重點實驗室西北農(nóng)林科技大學生命科學學院植物保護學院

摘要：Helitron是真核生物中存在的一種以滾環(huán)方式進行復(fù)制的轉(zhuǎn)座元件,關(guān)于其對動植物基因組的影響已有深入分析,而在真菌中則鮮有報道。本文對大豆囊孢線蟲的生防菌——明尼蘇達被毛孢Hirsutella minnesotensis中的Helitron轉(zhuǎn)座元件進行了系統(tǒng)分析,發(fā)現(xiàn)該真菌中存在兩類自主的Helitron元件HmHeli1和HmHeli2;其中HmHeli1不僅具有保守的末端序列和結(jié)構(gòu),而且編碼序列高度相似,甚至完全一致的Rep Hel轉(zhuǎn)座酶,表明其在基因組中發(fā)生了近期擴張并依舊活躍。HmHeli1符合Helitron2元件的結(jié)構(gòu)及編碼特征:5′和3′末端分別存在保守序列"TCAG"和"TATTTT",3′末端存在富含GC的發(fā)卡結(jié)構(gòu),近末端存在不對稱的反向重復(fù)序列;編碼的轉(zhuǎn)座酶包含鋅指、Rep和Helicase結(jié)構(gòu)域,但不包含核酸內(nèi)切酶結(jié)構(gòu)域。HmHeli1優(yōu)先同向插入基因富集區(qū),甚至功能基因內(nèi)部,插入位點存在一個短的富含AT的序列。HmHeli1不具主動捕獲基因的能力,但可被動接受其他轉(zhuǎn)座元件的插入。HmHeli1是一種結(jié)構(gòu)獨特、極具擴張力的DNA轉(zhuǎn)座元件,不僅在明尼蘇達被毛孢基因組進化中發(fā)揮著重要作用,并且具有開發(fā)為通用遺傳分析工具的潛能。 

 

基金：中央高?；究蒲袠I(yè)務(wù)費專項(2014YB032)； 寧陜科技合作項目~~；

 

關(guān)鍵詞：明尼蘇達被毛孢; HmHeli1; Helitron2; 末端反向重復(fù); 基因富集區(qū);