【作者】唐利華鮑大鵬萬佳寧李燕王瑩譚琦

【機(jī)構(gòu)】國(guó)家食用菌工程技術(shù)研究中心農(nóng)業(yè)部應(yīng)用真菌資源與利用重點(diǎn)開放實(shí)驗(yàn)室上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點(diǎn)開放實(shí)驗(yàn)室上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所

【摘要】轉(zhuǎn)錄因子在真菌環(huán)境響應(yīng)及生理過程中發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用。本文利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-Seq)技術(shù)研究光誘導(dǎo)香菇菌絲轉(zhuǎn)色過程中的轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)變化。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果表明,在光照條件下轉(zhuǎn)色的菌絲(313C)與黑暗條件下未轉(zhuǎn)色的菌絲(313W)相比,香菇菌絲中共有68個(gè)轉(zhuǎn)錄因子基因表達(dá)發(fā)生變化(48個(gè)轉(zhuǎn)錄因子上調(diào)表達(dá),20個(gè)轉(zhuǎn)錄因子下調(diào)表達(dá));轉(zhuǎn)色的菌絲(313C)與初始未轉(zhuǎn)色的菌絲(118)相比,香菇菌絲中有80個(gè)轉(zhuǎn)錄因子基因表達(dá)發(fā)生變化(49個(gè)轉(zhuǎn)錄因子上調(diào)表達(dá),31個(gè)轉(zhuǎn)錄因子下調(diào)表達(dá))。這些差異表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子包括WD40、MADS-box、MYB和GATA等家族。另外,樣品的兩兩比較中差異表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子既存在部分重疊,也表現(xiàn)特異性。其中,313C/313W中有14個(gè)特異性差異表達(dá)轉(zhuǎn)錄因子,313C/118中有26個(gè)特異差異表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子。重疊的轉(zhuǎn)錄因子有64個(gè),其中有39個(gè)表達(dá)水平上調(diào),15個(gè)表達(dá)水平下調(diào)。采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR對(duì)幾個(gè)轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)行了表達(dá)檢測(cè),其中部分轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)趨勢(shì)與轉(zhuǎn)錄組分析基本相同。這些數(shù)據(jù)為進(jìn)一步研究香菇轉(zhuǎn)色的轉(zhuǎn)錄調(diào)控奠定了一定的基礎(chǔ)。 

【基金】上海市市級(jí)農(nóng)口系統(tǒng)青年人才成長(zhǎng)計(jì)劃[滬農(nóng)青字(2015)第1-9號(hào)]； 國(guó)家自然科學(xué)基金(31170098)； 上海市科委崇明專項(xiàng)(13391912202)~~；

【關(guān)鍵詞】香菇; 轉(zhuǎn)色; 光線; 轉(zhuǎn)錄因子; 高通量測(cè)序;