【作者】李倩 閆淑珍 陳雙林
【機構】南京師范大學生命科學學院
摘要：為探討核糖體DNA轉錄間隔區(qū)(r DNA ITS)的RNA二級結構在黏菌系統(tǒng)發(fā)育研究中的作用,以黏菌ITS通用引物PHYS4和PHYS5對絨泡菌目5屬8種黏菌的r DNA ITS進行擴增和測序,利用RNA structure構建了ITS區(qū)的RNA二級結構模型。結果表明:ITS1在絨泡菌目黏菌中不能形成一個緊實的結構,但大部分物種都具有一段穩(wěn)定的螺旋結構,可能對r RNA的成熟具有作用;5.8S r RNA的二級結構相似,由4個螺旋組成,主要為兩種類型;基于5.8S r RNA和28S r RNA相互作用構建的ITS2的二級結構模型顯示,它由一個封閉的多分支環(huán)和至少4個主要的螺旋組成,其中螺旋IV結構相對比較保守。由于ITS區(qū)的二級結構相比核苷酸序列更加保守,因此深入地分析其二級結構有助于認識其結構與進化的關系。
基金：國家自然科學基金(31470143&31170014)； 江蘇省高校自然科學研究重大項目(12KJA180004)；
關鍵詞：絨泡菌目; ITS RNA二級結構; 模型; 互補性堿基變化; 分子進化;