【作者】馬橙 陳作紅 張平
【機(jī)構(gòu)】湖南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院應(yīng)用真菌研究室
【摘要】以SNPs作為分子標(biāo)記,對黑柄炭角菌的生活史和遺傳多樣性進(jìn)行研究?;诤诒拷蔷幕蚪M文庫,在兩個菌株(X-WC和X-LY)的34個片段(19,680bp)中共發(fā)現(xiàn)193個SNPs,SNP發(fā)生率為0.981%。193個SNPs位點都有兩個可變的核苷酸,其中132個轉(zhuǎn)換,61個顛換,轉(zhuǎn)換與顛換比率為2.16。此外,對兩個菌株序列進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)了41個插入/缺失位點。從34個片段中選擇4個片段,分別比較菌株內(nèi)的SNPs情況。X-WC的菌株內(nèi)SNP發(fā)生率為每個核苷酸1.308%(30/2293),X-LY的菌株內(nèi)SNP發(fā)生率為每個核苷酸1.352%(31/2293)。序列圖譜中有31個重疊峰,表明菌株X-LY的菌核是異核體。
【基金】Supported by the Key Scientific Research Fund of Hunan Provincial Education Department(No.08A044); National Natural Science Foundation of China(No.30770010); the Program for Excellent Talents in Hunan Normal University(No.2008-6);
【關(guān)鍵詞】黑柄炭角菌; 分子標(biāo)記; 單倍型; 異核體;