【作者】劉超洋 莊文穎

【機構(gòu)】中國科學(xué)院微生物研究所真菌地衣系統(tǒng)學(xué)重點實驗室中國科學(xué)院研究生院 北京100039北京100080北京 100080

【摘要】本文首次利用核酸二級結(jié)構(gòu)特征代替核酸堿基作為探討類群之間親緣關(guān)系的信號,構(gòu)建了基于結(jié)構(gòu)特征的子囊菌部分類群的系統(tǒng)進(jìn)化樹。該方法以S(規(guī)范的堿基對),Q(不規(guī)范的堿基對),I(單鏈),B(側(cè)環(huán)),M(多分枝環(huán))和H(發(fā)卡結(jié)構(gòu))為代碼將二級結(jié)構(gòu)特征區(qū)分為6種不同的亞結(jié)構(gòu)類型,然后將二級結(jié)構(gòu)特征轉(zhuǎn)換為結(jié)構(gòu)序列,并進(jìn)行結(jié)構(gòu)序列分析。該方法使rRNA不只局限于堿基比較,拓展了其應(yīng)用范圍,為揭示分子的功能與進(jìn)化的關(guān)系提供了線索。結(jié)果表明,結(jié)構(gòu)序列分析可用于子囊菌的系統(tǒng)學(xué)研究;相對于核酸序列分析,結(jié)構(gòu)分析的結(jié)果似乎更加清晰地體現(xiàn)子囊果的演化過程。 

【基金】National Natural Science Foundation of China (no. 30230020； 30470009)；

【關(guān)鍵詞】子囊菌門; 亞結(jié)構(gòu)類型; 結(jié)構(gòu)序列; 系統(tǒng)演化信號;