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    基于rDNAITS序列分析Alternaria與相似屬的關(guān)系及A.leucanthemi的分類地位


    【發(fā)布日期】:2018-03-27  【來源】:菌物學(xué)報(bào)
    【作者】趙國柱 張?zhí)煊睢〔軔坌隆⊥鹾閯P
    【機(jī)構(gòu)】山東農(nóng)業(yè)大學(xué)植物病理學(xué)系 中國科學(xué)院微生物研究所真菌地衣系統(tǒng)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 山東農(nóng)業(yè)大學(xué)植物病理學(xué)系 山東泰安271018 中國科學(xué)院微生物研究所真菌地衣系統(tǒng)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 北京100080
    【摘要】對(duì)Alternaria,Stemphylium,Ulocladium,Nimbya,Embellisia等五個(gè)形態(tài)相似屬的代表性種進(jìn)行了5.8S/ITS區(qū)段序列測定,連同從GenBank下載的相關(guān)有性型Pleospora,Lewia的同項(xiàng)資料,由Neighbor-joining方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。序列對(duì)比結(jié)果顯示,所有參試的菌株/種的5.8SrDNA序列保守程度較高,ITS序列變化較大,ITS1比ITS2變化更大。由5.8S/ITS構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹可以足夠?qū)⒐┰嚲鷧^(qū)分到屬;系統(tǒng)發(fā)育樹顯示Alternaria,Ulocladium,Nimbya和Embellisia系統(tǒng)學(xué)關(guān)系較近,又存在一定的分化;Stemphylium聚在相對(duì)較遠(yuǎn)的分支上,與上述四屬關(guān)系較遠(yuǎn),相對(duì)獨(dú)立進(jìn)化;有性型的Pleospora與無性型的Stemphylium被聚到一個(gè)分支,這種不同階段菌株在遺傳基礎(chǔ)上的一致,充分證明所用方法及所選測序的rDNA區(qū)段對(duì)本類群真菌的分類很有價(jià)值。Alternarialeucanthemi位于系統(tǒng)發(fā)育樹的外側(cè),較為獨(dú)立進(jìn)化,與Alternaria的其它種親緣關(guān)系較遠(yuǎn),卻與Stemphyliumspp.和Bipolarisspp.關(guān)系較近,對(duì)其目前的分類地位提出質(zhì)疑。 
    【基金】國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(39899400); 中國科學(xué)院微生物研究所真菌地衣系統(tǒng)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(915)課題資助;
    【關(guān)鍵詞】鏈格孢屬; 匍柄霉屬; 假格孢屬; 埃里格孢屬; 細(xì)基格孢屬; 系統(tǒng)學(xué);
     
     
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