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    突臍孢屬Brn1基因核苷酸序列比較及系統(tǒng)發(fā)育研究


    【發(fā)布日期】:2018-02-28  【來源】:菌物學(xué)報
    【作者】孫廣宇 張雅梅 張榮
    【機構(gòu)】西北農(nóng)林科技大學(xué)植保學(xué)院西北農(nóng)林科技大學(xué)植保學(xué)院 陜西楊凌712100
    【摘要】對所有供試突臍孢菌株的Brn1基因 (1, 3, 8 -三羥基萘還原酶基因) 擴增均獲得PCR產(chǎn)物。序列比較表明:在種內(nèi)各菌株間沒有核苷酸序列長度變化,存在核苷酸序列簡單代換;在種間核苷酸序列長度有變化,核苷酸的缺失或插入發(fā)生在內(nèi)含子區(qū);所有菌株編碼區(qū)核苷酸序列長度相同;在種內(nèi)水平氨基酸序列沒有差別,顯示出高度的保守性。利用最大簡約法(Maximum Parsimony)和鄰近結(jié)合法(Neighbor-joining)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,兩個系統(tǒng)發(fā)育樹的拓撲結(jié)構(gòu)相似,不同種在不同的分支上。Brn1基因適合突臍孢屬種級水平的分子系統(tǒng)學(xué)研究。 
    【基金】國家自然科學(xué)基金資助項目(項目編號:30170004);
    【關(guān)鍵詞】系統(tǒng)發(fā)育樹; 離蠕孢屬; 序列分析;
     
     
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