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    草菇泰國1號菌株交配型A因子分子遺傳學(xué)及生物信息學(xué)解析


    【發(fā)布日期】:2016-03-09
    【作者】 汪虹; 陳明杰; 馮愛萍; 譚琦; 鮑大鵬; 
     
    【Author】 WANG Hong;CHEN Mingjie;FENG Aiping;TAN Qi;BAO Dapeng;Institute of Edible Fungi,Shanghai Academy of Agricultural Sciences,Key Laboratory of Edible Fungi Resources and Utilization(South),Ministry of Agriculture,P.R.China;National Engineering Research Center of Edible Fungi,National R&D Center for Edible Fungi Processing,Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding of Shanghai;
     
    【機(jī)構(gòu)】 上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所農(nóng)業(yè)部南方食用菌資源利用重點實驗室國家食用菌工程技術(shù)研究中心國家食用菌加工技術(shù)研發(fā)分中心上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點開放實驗室; 
     
    【摘要】 采用簡并PCR引物獲得mip基因保守片段后,通過長片段PCR技術(shù)從草菇(Volvariella volvacea)菌株泰國1號孢子單核體中擴(kuò)增獲得了A1、A2交配型位點的DNA序列,結(jié)果表明:每個交配型位點均含2個交配型基因(HD1和HD2),其中A1位點的交配型基因為HD1-A1-TG和HD2-A1-TG,長度分別為1341bp和1450bp,各編碼446和429個氨基酸殘基;A2位點的交配型基因為HD1-A2-TG和HD2-A2-TG,長度分別為1442bp和1501bp,各編碼463和443個氨基酸殘基。利用生物信息學(xué)方法分析了泰國1號及另外兩株草菇代表性菌株V23和屏優(yōu)的交配型基因編碼的HD蛋白序列,結(jié)果表明:HD蛋白均含有同源異形結(jié)構(gòu)域。根據(jù)系統(tǒng)進(jìn)化樹可以看出,泰國1號與V23、屏優(yōu)菌株A位點HD1和HD2基因序列所編碼的氨基酸序列之間親緣關(guān)系復(fù)雜,可能具有不同的起源。 
     
    【關(guān)鍵詞】 草菇; A交配型基因; 同源異形結(jié)構(gòu)域蛋白; 
     
     
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