華中農(nóng)業(yè)大學(xué)植物科學(xué)技術(shù)學(xué)院邊銀丙教授領(lǐng)銜的羊肚菌課題組近日公布了梯棱羊肚菌線粒體物理圖譜繪制和進(jìn)化分析結(jié)果，論文發(fā)表在International Journal of Biological Macromolecules上(IF=4.7)。這是該課題組在梯棱羊肚菌（Morchella importuna）研究領(lǐng)域兩年內(nèi)發(fā)表的第4篇SCI論文。
      線粒體參與能量代謝、離子穩(wěn)態(tài)、細(xì)胞衰老和凋亡等事件。真菌線粒體基因組通常僅14個(gè)保守基因，基因組大小在11 kb至235.8kb 。該研究顯示，梯陵羊肚菌線粒體基因組總長(zhǎng)度272.2kp，這是迄今為止報(bào)道的最大的真菌線粒體基因組。除包含14個(gè)保守的線粒體編碼蛋白、2個(gè)核糖體大小亞基基因rRNA和32個(gè)tRNA外，還包含151個(gè)非保守線粒體ORF (ncORF)。保守蛋白、核糖體rRNA和tRNA總序列長(zhǎng)度僅占基因組8.52%；ncORF總長(zhǎng)度達(dá)89kb，占總長(zhǎng)度的34%。令人意外的是，這些ncORF中108個(gè)基因在梯棱羊肚菌營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)階段處于活躍表達(dá)狀態(tài)，暗示在梯棱羊肚菌線粒體基因組中可能具有某些特殊功能。
      梯陵羊肚菌超大的線粒體基因組中隱匿著大量散在重復(fù)序列，在10^-5的比對(duì)閾值下總計(jì)有2216個(gè)重復(fù)單元，重復(fù)序列的總長(zhǎng)度占基因組大小的18.7%，部分較大的序列單元具有高拷貝的重復(fù)次數(shù)。這種高度重復(fù)的特征也導(dǎo)致線粒體組裝難度較大，課題組采用了一種迂回策略完成了de novo的組裝。
      該院羊肚菌課題組以博士生劉偉為核心成員，主要從事羊肚菌屬遺傳及營(yíng)養(yǎng)生理研究，目前在國(guó)內(nèi)外羊肚菌研究領(lǐng)域已經(jīng)具有較大的影響力。
      論文銜接：https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2019.12.056