銀耳病害分為侵染性病害和非侵染性病害，侵染性病害由病原菌引起，非侵染性病害，有的是生理性病變引起，有的是生產(chǎn)管理失控造成。
　　1、白粉病  又叫白腐病，病源菌為頂孢頭霉。防治辦法：加強菇房通風(fēng)降濕，幼耳發(fā)生時可噴石灰硫磺合劑，并提前采收，用利刀連根刮除，耳基可涂抹4％石炭酸溶液，傍晚用50％霉腐劑粉劑煙熏。
　　2、僵縮病  病原菌茄鐮孢霉。防治辦法：原料曝曬，配料含水量不應(yīng)過高60％；穴口揭布前用50％敵敵畏乳油1000倍噴灑殺菌；割膜擴穴后空間濕度不超80％；幼耳階段發(fā)生時，可噴PH8的石灰上清液，成耳期提前采收，并用5％石灰水浸泡清洗后再加工干制。
　　3、黑蒂頭  防治辦法；發(fā)菌培養(yǎng)不超28℃為好，適時開口割膜擴穴增氧，促進(jìn)菌絲正常新陳代謝；幼耳階段噴水宜少宜勤，不宜過量，防止耳基旁積水：同時注意通風(fēng)換氣。
　　4、爛耳  防治辦法：防止培養(yǎng)基變酸，料袋滅菌后注意散熱，發(fā)菌培養(yǎng)防止超溫。長耳階段控制23－25℃，及時通風(fēng)，噴水適量，空間相對濕度85－95％之間。幼耳發(fā)現(xiàn)爛耳及時摘除、挖基，用石灰水涂擦后，再用100％甲基硫菌靈1000溶液噴灑控制；成耳霉?fàn)€提前柴收，并用25％福美雙1500倍液涂沫，控制病原菌蔓延。