迄今為止人工栽培真菌幾乎全部是腐生型種類,腐生類型約占大型真菌的30%以上。根據(jù)腐生真菌生長基質(zhì)的不同可分為3個類群:①木生類群。以倒木、樹樁、木材和立木為基質(zhì),主要有側(cè)耳屬、香菇屬、木耳屬、銀耳屬、猴頭屬、鱗傘屬以及田頭菇屬和多孔菌目的絕大多數(shù)種;②土生類群。包括以土壤和地表淺層腐殖質(zhì)層為基質(zhì)的種類(不含菌根菌),如羊肚菌屬、竹蓀屬、香蘑屬、小包腳菇屬、蘑菇屬和田頭菇屬的一些種;③糞生類群。以糞便、廄肥、腐爛草堆等有機廢料或垃圾為生長基質(zhì)的種類。鬼傘屬、蘑菇屬、田頭菇屬以及有毒的斑褶菇屬和裸蓋傘屬屬于此類型。
共生類型(菌根真菌)和寄生類型(蟲生真菌等)可以實施半人工栽培。結(jié)合植樹造林,人工促繁增產(chǎn),如松茸群和蟲草屬等。